AcsCentSci | 大規模G蛋白偶聯嗅覺受體配對數據及其建模
嗅覺受體 (OR) 的氨基酸序列如何編碼對各種配體的多樣化反應?一個基于 OR 序列相似性和配體物理化學特征的蛋白質化學計量學 (PCM) 模型…… Continue reading
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一種肽束縛策略,可用來篩選構象確定的多肽上的非天然側鏈片段。 背景介紹 合理設計的蛋白質二級和三級結構,可作為生物分子相互作用的調節劑??刂频鞍住?Continue reading
合成一系列甲酰肽受體 2 (FPR2) 激動劑分子來優化藥效和代謝穩定性,并通過對接分析了作用模式。生物學實驗表明,化合物能在分子水平和細胞水平…… Continue reading
TP-DB是從PDB中提取170萬個螺旋結構并編譯而成的一個治療肽設計數據庫,允許查詢化合物復合物模式以促進識別螺旋結構的序列基序。 背景介紹 …… Continue reading
數百條QM/MM軌跡證明,吸收光15fs后,反應激發態和鄰近態之間的簡并導致視紫紅質布局分裂為亞布局。 背景介紹 視紫紅質(Rhodopsin,…… Continue reading
MixMD發現了PD-1全新的可藥空腔,并通過虛篩得到結合于該空腔的名為1508的新型配體,為探索靶向PD-1?PD-L1復合物的癌癥治療提供了…… Continue reading
iANP-EC是一種集成計算框架,結合機器學習和進化計算可識別天然抗癌化合物。 背景介紹 在癌癥治療中,盡管化療和放療有嚴重的副作用,但它們仍是…… Continue reading
兩種新計算方法組成的工作流用于執行特定小分子結合任務?;跀祿寗拥腄EPACT可以設計和評估小分子結合的口袋能否作為獨立的團簇,而PACMat…… Continue reading
DD-GUI 是英屬哥倫比亞大學團隊聯合NVIDIA開發的深度學習和對接的圖形用戶界面,名為“深度對接”。DD-GUI 能直觀且便捷地設置大規?!?Continue reading
通過關注肽和蛋白質的相互作用,首次從計算角度對肽結合位點進行的全面的形態學和能量學研究。 背景介紹 肽-蛋白相互作用與許多細胞和代謝系統的信號轉…… Continue reading