通過經典分子動力學和元動力學模擬，從分子間相互作用、二級結構、平均力勢和自由能等方面研究了三種藥物對肽細胞毒性的影響，以分析最適合治療神經退行性…… Continue reading →

對Specs庫進行虛擬篩選得到的兩個靶向GyrB的抗結核桿菌抑制劑具有IC50 值分別為2.69 和 2.46 μM的生物學活性，并通過分子動力…… Continue reading →

合成一系列甲酰肽受體 2 (FPR2) 激動劑分子來優化藥效和代謝穩定性，并通過對接分析了作用模式。生物學實驗表明，化合物能在分子水平和細胞水平…… Continue reading →

MixMD發現了PD-1全新的可藥空腔，并通過虛篩得到結合于該空腔的名為1508的新型配體，為探索靶向PD-1?PD-L1復合物的癌癥治療提供了…… Continue reading →

Polyply包含了：1)一種多尺度圖匹配算法，用于快速生成參數，并適用于任意復雜的聚合物拓撲；2)通用的多尺度隨機行走協議，能夠高效地建立復雜…… Continue reading →

通過高通量虛擬篩選發現了MCULE-5948770040，一種作用于SARS-CoV-2主要蛋白酶的新型非共價小分子抑制劑。進一步的濕實驗、X射…… Continue reading →

通過QM/MM分子動力學模擬和同位素標記實驗，作者發現在倍半萜SdS合成酶中去質子化-再質子化序列可以通過G1/2 helix這段保守結構域的主…… Continue reading →

SARS-CoV-2的突變體是如何影響RBD-ACE2復合物的形成的呢？原子力顯微鏡和分子動力學模擬揭示了關于SARS-CoV-2突變體結合的原…… Continue reading →

通過實驗結合計算的方法，證明了四環素衍生物對FP-2的變構抑制作用，預測了可能的結合模式，為進一步優化四環素骨架及發現選擇性更好效力更強的抑制劑…… Continue reading →

通過分子對接、虛擬篩選、MD結合生物活性實驗，中科院上藥所柳紅團隊獲得了GLP-1R的亞微摩爾級別的正變構調節劑，為設計B類GPCR的小分子藥物…… Continue reading →