分子動力學 | 唯信計算 Wecomput http://www.tjthrhy.com 中大唯信 | 唯信計算 | AI制藥 | 藥物設計軟件 | AIDD | CADD | 人工智能 | 機器學習 | 深度學習 | 分子對接 | 分子動力學模擬 | 同源模建 | 蛋白設計 | 抗體設計 | 自組裝模擬 | 計算模擬 | 藥物設計 | 分子模擬 | 量化計算 | 量子化學 | GPU計算 Mon, 30 May 2022 00:26:21 +0000 zh-CN hourly 1 https://wordpress.org/?v=5.6 http://www.tjthrhy.com/wp-content/uploads/2015/09/cropped-LOGO-icon-32x32.png 分子動力學 | 唯信計算 Wecomput http://www.tjthrhy.com 32 32 RCS Advance | 計算模擬論證兩種他汀類藥物和克羅莫林作為抗Aβ肽的細胞毒性的潛在藥物 http://www.tjthrhy.com/rcs-advance-computational-simulations-demonstrated-two-statins-and-clomoline-as-potential-agents-against-the-cytotoxicity-of-a%ce%b2-peptide/ Mon, 30 May 2022 00:20:04 +0000 http://www.tjthrhy.com/ab68fbb04e/ 通過經典分子動力學和元動力學模擬，從分子間相互作用、二級結構、平均力勢和自由能等方面研究了三種藥物對肽細胞毒性的影響，以分析最適合治療神經退行性…… Continue reading →

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]]> JCIM | 有效抗結核分枝桿菌DNA促旋酶抑制劑的發現 http://www.tjthrhy.com/jcim-discovery-of-effective-dna-helicase-inhibitors-against-mycobacterium-tuberculosis/ Tue, 17 May 2022 04:00:49 +0000 http://www.tjthrhy.com/54ef5e4c7b/ 對Specs庫進行虛擬篩選得到的兩個靶向GyrB的抗結核桿菌抑制劑具有IC50 值分別為2.69 和 2.46 μM的生物學活性，并通過分子動力…… Continue reading →

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]]> JMC | 甲酰肽受體 2 (FPR2) 脲基丙酰胺類激動劑的設計、合成與生物學評價 http://www.tjthrhy.com/jmc-design-synthesis-and-biological-evaluation-of-formyl-peptide-receptor-2-fpr2-urea-propionamide-agonists/ Wed, 23 Mar 2022 01:34:34 +0000 http://www.tjthrhy.com/b745ab45a4/ 合成一系列甲酰肽受體 2 (FPR2) 激動劑分子來優化藥效和代謝穩定性，并通過對接分析了作用模式。生物學實驗表明，化合物能在分子水平和細胞水平…… Continue reading →

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]]> JCIM | 探針動力學和虛擬篩選如何幫助PD-1全新位點及新配體的發現？ http://www.tjthrhy.com/jcim-how-can-probe-dynamics-and-virtual-screening-help-in-the-discovery-of-novel-pd-1-sites-and-ligands/ Wed, 09 Mar 2022 01:11:07 +0000 http://www.tjthrhy.com/5dee906515/ MixMD發現了PD-1全新的可藥空腔，并通過虛篩得到結合于該空腔的名為1508的新型配體，為探索靶向PD-1?PD-L1復合物的癌癥治療提供了…… Continue reading →

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]]> Nat. Commun. | Polyply：用于大分子和納米材料模擬的python套件 http://www.tjthrhy.com/nat-commun-polyply-python-suite-for-macromolecular-and-nanomaterial-simulations/ Wed, 16 Feb 2022 01:24:53 +0000 http://www.tjthrhy.com/b55b2fac61/ Polyply包含了：1)一種多尺度圖匹配算法，用于快速生成參數，并適用于任意復雜的聚合物拓撲；2)通用的多尺度隨機行走協議，能夠高效地建立復雜…… Continue reading →

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]]> JCIM | SARS-CoV-2主要蛋白酶非共價抑制劑的高通量虛擬篩選與驗證 http://www.tjthrhy.com/jcim-sars-cov-2-high-throughput-virtual-screening-and-validation-of-non-covalent-inhibitors-of-major-proteases/ Thu, 10 Feb 2022 00:54:56 +0000 http://www.tjthrhy.com/d69e9e6d7d/ 通過高通量虛擬篩選發現了MCULE-5948770040，一種作用于SARS-CoV-2主要蛋白酶的新型非共價小分子抑制劑。進一步的濕實驗、X射…… Continue reading →

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]]> Nat. Catal. | What?蛋白主鏈竟能直接參與酶催化反應! http://www.tjthrhy.com/nat-catal-what-protein-main-chain-can-directly-participate-in-enzymatic-reaction/ Mon, 07 Feb 2022 01:30:00 +0000 http://www.tjthrhy.com/52b94e5521/ 通過QM/MM分子動力學模擬和同位素標記實驗，作者發現在倍半萜SdS合成酶中去質子化-再質子化序列可以通過G1/2 helix這段保守結構域的主…… Continue reading →

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]]> Nat. Commun. | 從分子角度分析SARS-CoV-2突變體的受體結合能量 http://www.tjthrhy.com/nat-commun-the-receptor-binding-energy-of-sars-cov-2-mutants-was-nalyzed-from-a-molecular-perspective/ Thu, 27 Jan 2022 00:52:31 +0000 http://www.tjthrhy.com/14c61f832b/ SARS-CoV-2的突變體是如何影響RBD-ACE2復合物的形成的呢？原子力顯微鏡和分子動力學模擬揭示了關于SARS-CoV-2突變體結合的原…… Continue reading →

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]]> JCIM | 四環素衍生物可在變構位點結合并抑制瘧原體半胱氨酸蛋白酶 http://www.tjthrhy.com/jcim-tetracycline-derivatives-bind-to-allosteric-sites-and-inhibit-cysteine-proteases-in-plasmodium-malariae/ Mon, 24 Jan 2022 00:55:30 +0000 http://www.tjthrhy.com/f2af40dd8b/ 通過實驗結合計算的方法，證明了四環素衍生物對FP-2的變構抑制作用，預測了可能的結合模式，為進一步優化四環素骨架及發現選擇性更好效力更強的抑制劑…… Continue reading →

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]]> ACS Chem. Bio. | 增強GLP1與GLP-1R結合的變構調節劑的發現 http://www.tjthrhy.com/acs-chem-bio-discovery-of-allosteric-modulators-that-enhance-binding-of-glp1-to-glp-1r/ Mon, 13 Dec 2021 01:19:23 +0000 http://www.tjthrhy.com/37ce58daee/ 通過分子對接、虛擬篩選、MD結合生物活性實驗，中科院上藥所柳紅團隊獲得了GLP-1R的亞微摩爾級別的正變構調節劑，為設計B類GPCR的小分子藥物…… Continue reading →

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