前沿(第八期):JCIM | 分子動力學模擬揭示BAX蛋白的激活機制
背景介紹 細胞凋亡是細胞內重要的生理過程,這一過程能夠幫助維持細胞穩態和代謝平衡。BAX蛋白是Bcl-2家族的促細胞凋亡成員,它通過引起線粒體外…… Continue reading
背景介紹 細胞凋亡是細胞內重要的生理過程,這一過程能夠幫助維持細胞穩態和代謝平衡。BAX蛋白是Bcl-2家族的促細胞凋亡成員,它通過引起線粒體外…… Continue reading
背景介紹 冠狀病毒是RNA病毒,可感染人類和動物并引起呼吸道疾病,包括嚴重急性呼吸系統綜合癥(SARS)和中東呼吸綜合癥(MERS)。這些病毒嚴…… Continue reading
引言 自然界除了作為生命基石的20種原型氨基酸外,還有多種表現出不同生理功能的非典型氨基酸(ncAAs),它們同樣可廣泛用作生物活性產物的中間體…… Continue reading
引言 最近,有研究表明,某些抗癌藥物與特定的小分子染料(如剛果紅或IR783)共配,可以形成具有超高載藥量的穩定納米粒子。因此,研究者提出,通過…… Continue reading
引言 耐藥性通過藥物靶點的突變威脅到許多重要的治療方法。人們對于突變尤其是遠離活性位點的突變的組合,其改變藥物結合以賦予耐藥性的分子機制了解甚少…… Continue reading
引言 在藥物發現過程中,準確預測小分子的疏水性是一個重要的問題。細胞和整個人體內部存在許多不同的化學環境。例如,藥物必須穿過疏水性細胞膜達到其細…… Continue reading
引言 從頭設計治療分子,仍然是一個成本和時間密集的過程,新藥物通常需要超過10年的時間和20-30億美元,才能進入市場,成功率可能低至<1…… Continue reading
引言 分子動力學模擬依靠經驗的勢函數模型來描述分子的相互作用。利用由機器學習方法衍生的數據驅動模型,可以提高這些勢函數的準確性和可轉移性。本文提…… Continue reading
引言 全細胞建模與仿真,是21世紀的重大挑戰之一,更是系統生物學的終極目標。利用現有的實驗確定的信息,進行的詳細的全細胞模型及其模擬,可用來探索…… Continue reading
引言 外排轉運蛋白P-糖蛋白(P-gp)負責從細胞中轉運包括藥物分子在內的多種分子。因此,P-gp介導的外排轉運限制了藥物的生物利用度。為了在藥…… Continue reading