分子對接 | 唯信計算 Wecomput http://www.tjthrhy.com 中大唯信 | 唯信計算 | AI制藥 | 藥物設計軟件 | AIDD | CADD | 人工智能 | 機器學習 | 深度學習 | 分子對接 | 分子動力學模擬 | 同源模建 | 蛋白設計 | 抗體設計 | 自組裝模擬 | 計算模擬 | 藥物設計 | 分子模擬 | 量化計算 | 量子化學 | GPU計算 Wed, 23 Mar 2022 01:47:53 +0000 zh-CN hourly 1 https://wordpress.org/?v=5.6 http://www.tjthrhy.com/wp-content/uploads/2015/09/cropped-LOGO-icon-32x32.png 分子對接 | 唯信計算 Wecomput http://www.tjthrhy.com 32 32 JMC | 甲酰肽受體 2 (FPR2) 脲基丙酰胺類激動劑的設計、合成與生物學評價 http://www.tjthrhy.com/jmc-design-synthesis-and-biological-evaluation-of-formyl-peptide-receptor-2-fpr2-urea-propionamide-agonists/ Wed, 23 Mar 2022 01:34:34 +0000 http://www.tjthrhy.com/b745ab45a4/ 合成一系列甲酰肽受體 2 (FPR2) 激動劑分子來優化藥效和代謝穩定性，并通過對接分析了作用模式。生物學實驗表明，化合物能在分子水平和細胞水平…… Continue reading →

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]]> ACS Chem. Bio. | 氫-氘交換質譜和計算建模對降解誘導的三元復合物的結構表征：對SBDD的啟示 http://www.tjthrhy.com/acs-chem-bio-structural-characterization-of-degradation-induced-ternary-complexes-by-hydrogen-deuterium-exchange-mass-spectrometry-and-computational-modeling-implications-for-sbdd/ Mon, 17 Jan 2022 00:54:54 +0000 http://www.tjthrhy.com/6588ef5d6c/ 使用氫-氘交換質譜(HDX-MS)結合計算建模，提供了一種新穎的方法來可視化降解誘導的三元復合物，體現了理性降解劑設計的思想，是第一個利用溶液數…… Continue reading →

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]]> JMC | 片段空間自動搜索算法發現全新BRD4配體骨架 http://www.tjthrhy.com/jmc-novel-brd4-ligand-skeleton-was-discovered-by-fragment-space-automatic-search-algorithm/ Mon, 10 Jan 2022 00:57:11 +0000 http://www.tjthrhy.com/bacd20e5f5/ 一種基于幾何結構軟件和深度學習的新框架DeepPoc一套挖掘苗頭片段周圍的化學空間的流程，它可以找到結合模式相似且新穎的類似物。在對BRD4案例…… Continue reading →

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]]> JMC | 吡唑羅[3,4 d]吡嗪酮類DDR1抑制劑的設計、合成與評價 http://www.tjthrhy.com/jmc-design-synthesis-and-evaluation-of-pyrazolol-34-d-ddr1-inhibitors-of-pyrazinones/ Tue, 04 Jan 2022 00:53:20 +0000 http://www.tjthrhy.com/d8557cac5c/ 中科院上藥所鄭明月研究員團隊利用深度生成模型、激酶選擇性篩選等計算手段，設計了一種新型DDR1抑制劑，該化合物能有效抗炎，在DSS誘導的小鼠結腸…… Continue reading →

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]]> JCIM | NLDock：一種用于復合物建模的快速核酸-配體對接算法 http://www.tjthrhy.com/jcim-nldock-a-fast-nucleic-acid-ligand-docking-algorithm-for-complex-modeling/ Wed, 13 Oct 2021 00:59:00 +0000 http://www.tjthrhy.com/1161ee3cad/ NLDock將現有的核酸-配體相互作用評分函數ITScoreNL集成到MDock程序的升級版本中，結合模式預測準確性優于Glide等且計算效率有…… Continue reading →

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]]> JCIM | AutoDock Vina 1.2.0來啦，綁定python獻上新方法 http://www.tjthrhy.com/jcim-autodock-vina-1-2-0-come-binding-python-presented-new-methods/ Sat, 14 Aug 2021 09:27:07 +0000 http://www.tjthrhy.com/4aa9ece550/ 背景介紹 AutoDock Vina (Vina)、AutoDock4 (AD4)、AutoDock-GPU、AutoDockFR以及AutoD…… Continue reading →

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]]> Chem | 綜述：靶向RNA小分子的理性設計 http://www.tjthrhy.com/chem-review-the-rational-design-of-targeted-rna-molecules/ Sat, 17 Jul 2021 14:02:26 +0000 http://www.tjthrhy.com/2243902152-2/ 背景介紹 近年來，研究人員已經確定了某些RNA可作為小分子治療幾種人類病理的藥物靶點。然而，由于其固有的結構靈活性和較差的結構-功能關系，對這些…… Continue reading →

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]]> 前沿(第六期)：JCIM | 常見對接程序基于Mpro靶點的準確性測試 http://www.tjthrhy.com/cutting-edge-6-jcim-common-docking-procedure-based-on-mpro-targets-on-the-accuracy-of-the-test/ Sat, 26 Jun 2021 05:07:45 +0000 http://www.tjthrhy.com/2a637d0c97/ 背景介紹 冠狀病毒是RNA病毒，可感染人類和動物并引起呼吸道疾病，包括嚴重急性呼吸系統綜合癥(SARS)和中東呼吸綜合癥(MERS)。這些病毒嚴…… Continue reading →

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]]> JCIM | MSLDOCK: 一種適合高柔性配體的虛擬篩選方法 http://www.tjthrhy.com/cim-msldock-a-virtual-screening-method-for-high-flexible-ligand/ Fri, 09 Apr 2021 23:56:00 +0000 http://www.tjthrhy.com/f87f1354bd/ 引言 Autodock(自動對接)及其各種變體是廣泛應用的對接方法，它們采用優化方法作為柔性配體對接和虛擬篩選的搜索算法。但其中許多方法存在高柔…… Continue reading →

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]]> JACS | 共價對接發現難成藥靶點eIF4E共價抑制劑 http://www.tjthrhy.com/covalence-dock-eif4e/ Thu, 26 Mar 2020 04:38:33 +0000 http://www.tjthrhy.com/28656bd764/   引言 真核翻譯起始因子4E（eIF4E）能刺激與癌細胞生長和轉移有關的蛋白翻譯。eIF4E歷來是極富挑戰性的靶標，抑制劑較少且藥效…… Continue reading →

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