JCIM | 通過計算工具模擬藥物篩選中的競爭實驗
基于從機理上理解復雜的生物相互作用系統的PyBindingCurve技術開發的CLAffinity,可利用藥物篩選過程中常見的蛋白、配體和抑制劑…… Continue reading
基于從機理上理解復雜的生物相互作用系統的PyBindingCurve技術開發的CLAffinity,可利用藥物篩選過程中常見的蛋白、配體和抑制劑…… Continue reading
TP-DB是從PDB中提取170萬個螺旋結構并編譯而成的一個治療肽設計數據庫,允許查詢化合物復合物模式以促進識別螺旋結構的序列基序。 背景介紹 …… Continue reading
DD-GUI 是英屬哥倫比亞大學團隊聯合NVIDIA開發的深度學習和對接的圖形用戶界面,名為“深度對接”。DD-GUI 能直觀且便捷地設置大規?!?Continue reading
背景介紹 基于片段的藥物發現(FBDD)已經成為一個用來識別探針分子和先導化合物的強大工具。過去20年里,FBDD發現了4種已批準的藥物,數十種…… Continue reading
Polyply包含了:1)一種多尺度圖匹配算法,用于快速生成參數,并適用于任意復雜的聚合物拓撲;2)通用的多尺度隨機行走協議,能夠高效地建立復雜…… Continue reading
Hu-mAb工具可以對輸入序列進行人源化評分,同時提示可降低免疫原性并保持療效的人源化突變位點,以此加速人源化過程。 背景介紹 單克隆抗體(mA…… Continue reading
CS-Annotate的核心是一種多任務深度學習模型的運用,可以同時從化學位移指紋中對溶劑暴露、堿基堆積和配對狀態以及單個RNA殘基構象進行分類…… Continue reading
IsAb是一個專注于抗體重新設計的計算協議,主要是優化抗體序列。協議全面且免費,方便來自不同領域的用戶快速上手。 背景介紹 抗體重新設計是在已知…… Continue reading
ProteinTools不同于只含單一應用的蛋白結構分析軟件,它以web服務形式提供了四種程序:疏水簇識別、氫鍵網絡識別、鹽橋識別和接觸圖識別?!?Continue reading
目前,治療耐藥菌感染患者的藥物種類十分有限,急需開發抗菌肽(AMPs)。本文匯總現有技術下對AMPs的結構、動力學和功能開展的研究,有利于與實驗…… Continue reading