基于從機理上理解復雜的生物相互作用系統的PyBindingCurve技術開發的CLAffinity，可利用藥物篩選過程中常見的蛋白、配體和抑制劑…… Continue reading →

TP-DB是從PDB中提取170萬個螺旋結構并編譯而成的一個治療肽設計數據庫，允許查詢化合物復合物模式以促進識別螺旋結構的序列基序。 背景介紹 …… Continue reading →

DD-GUI 是英屬哥倫比亞大學團隊聯合NVIDIA開發的深度學習和對接的圖形用戶界面，名為“深度對接”。DD-GUI 能直觀且便捷地設置大規?！?Continue reading →

背景介紹 基于片段的藥物發現(FBDD)已經成為一個用來識別探針分子和先導化合物的強大工具。過去20年里，FBDD發現了4種已批準的藥物，數十種…… Continue reading →

Polyply包含了：1)一種多尺度圖匹配算法，用于快速生成參數，并適用于任意復雜的聚合物拓撲；2)通用的多尺度隨機行走協議，能夠高效地建立復雜…… Continue reading →

Hu-mAb工具可以對輸入序列進行人源化評分，同時提示可降低免疫原性并保持療效的人源化突變位點，以此加速人源化過程。 背景介紹 單克隆抗體（mA…… Continue reading →

CS-Annotate的核心是一種多任務深度學習模型的運用，可以同時從化學位移指紋中對溶劑暴露、堿基堆積和配對狀態以及單個RNA殘基構象進行分類…… Continue reading →

IsAb是一個專注于抗體重新設計的計算協議，主要是優化抗體序列。協議全面且免費，方便來自不同領域的用戶快速上手。 背景介紹 抗體重新設計是在已知…… Continue reading →

ProteinTools不同于只含單一應用的蛋白結構分析軟件，它以web服務形式提供了四種程序：疏水簇識別、氫鍵網絡識別、鹽橋識別和接觸圖識別?！?Continue reading →

目前，治療耐藥菌感染患者的藥物種類十分有限，急需開發抗菌肽（AMPs）。本文匯總現有技術下對AMPs的結構、動力學和功能開展的研究，有利于與實驗…… Continue reading →