背景介紹 AutoDock Vina (Vina)、AutoDock4 (AD4)、AutoDock-GPU、AutoDockFR以及AutoD…… Continue reading →

引言 蛋白質工程（Protein Engineer）具有巨大的學術和工業潛力。然而，在浩瀚的蛋白質序列空間中進行搜索的能力限制了我們的設計，但是…… Continue reading →

研究背景 盡管近40年前開發出了第一批對接程序，我們可以使用不同的方法(搜索算法，分為系統和隨機搜索方法)來尋找和評估(評分函數，分為基于經驗的…… Continue reading →

引言 Autodock(自動對接)及其各種變體是廣泛應用的對接方法，它們采用優化方法作為柔性配體對接和虛擬篩選的搜索算法。但其中許多方法存在高柔…… Continue reading →

引言 數據集是深度學習模型開發的基礎，深度學習模型的成功在很大程度上取決于數據集的質量和大小。在這項工作中，作者提出了一個新的數據集準備步驟，并…… Continue reading →

引言 深度學習的質量和效率，在很大程度上，取決于被學習對象的表示。特別是，增強的藥物學習，依賴于適當的分子表征(MolRs)。通過直接從分子的底…… Continue reading →

引言 貝葉斯優化算法是一種基于響應面的迭代全局優化算法，在機器學習模型的調整中表現出了卓越的性能。貝葉斯優化最近也在化學領域得到了應用，然而，它…… Continue reading →

引言 計算能力的提高與快速算法的發展使得量子化學方法可以應用于生物大分子的計算。與此同時對此類大型系統的大量電子結構信息進行處理也需要新穎的技術…… Continue reading →

引言 不對稱催化是探索新的化學空間的一種方法，今天的計算能力足以協助這一探索。不幸的是，現有技術通常需要專業的計算知識而導致其未在合成化學中被充…… Continue reading →