藥物研發離不開與各種蛋白質或核酸序列打交道，雖然word和excel可以進行簡單的查看或編輯，不過面對抗體編號、CDR注釋、序列比對、進化分析、頻率分析等更專業的需求，是否有更專業、高效、易用的解決方案？不妨試試這款神器吧，立刻解放雙手，提高生產力！
唯信計算開發出了全功能的在線序列編輯器——WeSeq，支持對序列進行編號、比對、注釋、編輯、分析等一系列操作，并已集成到分子智能計算平臺WeMol中，登錄WeMol Cloud（wemol.wecomput.com，詳情參見往期文章）即可使用，并且WeSeq永久免費！一起來看看都有哪些功能吧~
File：序列文件的導入導出，支持fasta等文本格式，也可以導出圖片；
Edit：支持序列的新建、刪除、拷貝、復制和重設對齊；
Numbering：抗體編號及CDR標注，包括可變區Kabat、IMGT、Chothia及恒定區EU編號；
Toggle *：以第一條序列為參考，不保守殘基突出顯示模式；
Align：多重序列比對（MSA），同時生成進化樹（Phylogenetic Tree）；
Annotation：可用于給一段序列或蛋白位點標注；
Editor：序列及ID的編輯器，支持殘基的插入、刪除、突變等；
Search：支持對特定序列進行全局檢索以及高亮；
Logo：分析殘基多樣性，生成sequence logo圖；
Wrap：切換序列的單多行顯示模式；
Color：切換氨基酸的顯示顏色（按理化性質）。
支持蛋白質/多肽/抗體、核酸等各類序列，可自由控制序列的縮放與平移，長序列支持換行顯示（Wrap）。
由Kabat等人在1991年基于相同結構域類型的序列之間的高序列變異區域的位置而開發的編號系統。輕鏈（λ，κ）可變區和抗體重鏈的氨基酸序列，以及T細胞受體的可變區（α，β， γ，δ）對齊并編號。是編號抗體殘基被廣泛采用的標準，但對非常規長度的抗體鏈具有獨特的插入或缺失。
2003年，Lefranc等人基于種系V基因的氨基酸序列比對為免疫球蛋白超家族的所有蛋白質序列引入了新的標準化編號系統，包括來自抗體輕鏈和重鏈的可變結構域以及來自不同物種的T細胞受體鏈。從1到128連續計數殘基。
與Kabat類似，1987年，Chothia和Lesk為抗體可變區引入了基于結構的編號方案。它們對齊抗體可變區的晶體結構，定義了形成CDR的環結構，并校正了CDRL1和CDRH1內插入點的位置編號，使它們更適合其拓撲位置。此外，他們將重鏈和輕鏈的CDR環分類為少量保守結構，稱為canonical類。
上個世紀60年代末（1968）Gerald M.Edelman等人分離純化得到一個人IgG1免疫球蛋白，將其命名為Eu。測定了其氨基酸序列并編號。這套編號沿用為Eu Numbering?，F在一般將其用作標注Fc域的工具。
上述4種抗體編號規則WeSeq都支持，其中前3個編號規則主要用于可變區編號，EU則主要用于給Fc編號。當執行Numbering后，光標置于氨基酸上可在右上角看到該位點的編號。
給Fc區域編號后，可直觀定位到突變位點位于哪些Fc結構域。
橘色線條為EU系統標注的Fc域，紅框為Margetuximab相對于lgG1的突變位點
比對的同時會進行進化分析，生成進化樹圖（系統發育樹）。
在生物信息分析中，序列標識圖Sequence Logo常用來分析序列中的保守位點及氨基酸頻率。在WeSeq中，只需點擊Logo按鈕即可一鍵生成高質量的序列標識圖。
SARS-CoV-2的3種變異毒株的Sequence Logo圖
選中需要突變的氨基酸，通過”Editor”即可進行修改，方便進行插入，刪除，突變等操作。
Annotation功能可以給任意一段序列或位點添加注釋，支持色塊、下劃線等多種注釋顯示方式。
WeSeq作為一個專業的在線序列編輯器與分析工具，能夠很好地解決醫藥研發相關人員對于核酸序列和蛋白質序列進行所有常規的分析操作的需求，包括序列比對、序列檢索、抗體編號等等，替代word和excel等軟件，解放雙手，提高生產力，賦能大分子藥物研發，快來試試吧~
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